【公路】日本在全國建立了比較完備的公路網。目前，公路總里程約121.4萬公里。其中，國道和省道公路約18.4萬公里，高速公路8050.3公里。由于高速公路是交通運輸中最重要的線路之一，日本每年投人大量資金維護和建設道路系統。目前，日本國內貨物運輸總量(按運輸噸公里總數統計)約60%由汽車運輸承擔(按運輸噸數則為約90%，對滿足日本工業生產以及國民生活的需要發揮了重要作用。由于日本四周環海，在公路與鐵路方面與周邊國家尚不存在互聯互通的情況。

【鐵路】鐵路曾經是日本國內重要的運輸工具，但隨著汽車的日益普及，鐵路的地位不斷下降，特別是貨物運輸所占比重下降幅度更大，旅客運輸雖然也大幅下降，但在東京及周邊地區，鐵路仍然發揮著重要作用。地鐵仍是日本人日常出行的主要市內交通工具，尤其東京的地鐵網絡更是發達，東京地鐵系統擁有13條線路，285座車站，線路總長365.2公里。東京地鐵的日平均客流量為1100萬人次，是世界上客流量最大的地鐵系統。

目前，日本鐵路營業里程為2.01萬公里，每100平方公里有5.3公里營業鐵路，2013年有236.1億人次乘坐旅客列車。1964年開通的新干線是日本鐵路的代表，由于安全、準時受到人們歡迎。日本現有6條新干線，另有3條正在建設中。日本的新干線在國際上知名度較高，近年來日本政府也加大了新干線裝備及技術出口力度，尤其對東南亞各國的基礎設施建設最感興趣，日本政府通過ODA援助等方式支持日本企業參與東南亞新興市場國家的基礎設施建設，促進新干線等裝備技術出口。

【空運】日本的航空業相當發達。以東京成田和羽田機場以及大阪關西機場為中心，形成了四通八達的空運網絡，目前，2013年年運旅客超過100萬人次的機場有27個。其中，成田國際機場年旅客吞吐量居日本第二位(第一位羽田機場)，貨運吞吐量居日本第一、全球第三。成田機場也是日本航空、全日空、美國聯合航空公司、美國西北航空公司的亞洲樞紐港。

日本主要的航空公司有日本航空公司(JAL)、日本航空運輸公司(AllNippon Airways Co.，簡稱“全日空”)，年運送旅客約1億人次，運輸貨物約220萬噸。據日本國土交通省的航空運輸統計數據顯示，2014年度日本各大航空公司國內航線運送客人數量為9450萬人次，同比增加3.9% ,國內航空貨物運輸量9366.2萬噸，同比增長1.3%;國際航線客運數量1604萬人次，同比增長7.9，國際航空貨物運輸量138.9萬噸，同比增長15.4% o  

目前，北京、上海、廣州、沈陽、大連、青島等多個中國城市均與日本東京、大阪等機場開通了國際航線。

【水運】作為島國，日本對外貿易主要依靠海運。全國主要港口有神戶、橫濱、千葉、名古屋、大阪、北九州等。2011年，日本有各類商船4164艘，總噸數達1536.6萬噸。由于掛靠其他國家可以降低成本，許多日本船舶都在其他國家注冊。

【郵政】日本很早就建立起發達的郵政業。目前，全國共有郵局約24000個。2007年10月實施郵政民營化以來，原有郵政集團業分拆為郵政、郵政儲蓄、簡易生命保險等幾個公司，繼續提供相關服務。

【電話】固定電話已經基本覆蓋日本全國，移動電話的發展也非常迅速，截至2013年9月底，全國手機客戶簽約總數達到了1億5097萬件，超過日本總人口數。

【互聯網】2014年日本互聯網普及率達90.58%。使用費用因上網方式不同差別較大，與其他國家部分城市相比費用相對較低。

【電力】為保證經濟發展和國民生活需求，日本建立了龐大的發電體系，日本各類發電廠的總裝機容量為281099萬千瓦。由于日本東京電力和東北電力供電區設備在日本大地震中遭受重創，且福島核危機后各地核電站相繼停運，導致全國發電量下滑，供電形勢緊張。據日本電力事業聯合會公布數據，2014年度(2014年4月1日至2015年3月31日)日本發電量為8938.3億千瓦時，其中核電站發電量為零。2014年度發電量與前一年度相比減少3.1%，連續4年呈現減少趨勢。